Spuštena je zavjesa i na takmičarsku sezonu 2016./2017.godine u Prvoj rukometnoj ligi FBiH za muškarce – grupa Jug.

Bugojanska Iskra u posljednjem kolu, u dvorani KSC-a, ugostila je sastav Igmana sa Ilidže, i ubilježila uvjerljivu pobjedu od 34 : 17, poluvrijeme 19 : 9.

Bila je to utakmica u kojoj je od početka do kraja dominirala domaća ekipa. Već u 10, minuti, kada su gosti postigli svoj drugi pogodak, prednost za Iskru je iznosila 6 golova. Na poluvrijeme se otišlo sa 10 golova razlike u korist domaćih rukometaša i već tada je bilo jasno da bodovi ostaju u Bugojnu.

U drugom dijelu susreta trener Iskre Fuad Mahmutović pružio je priliku svim igračima sa klupe a oni su se odužili na način da su se svi upisali u strijelce, te susret okončali sa dvostrukom razilkom golova u svoju korist. Efikasniji od ostalih u ovom duelu bili su Nikola Marjanović sa 6, te Džejlan Kaltak i Elmir Mujić sa po 5 postignutih golova. Odličan na golu bio je kapiten Frane Đikić sa 16 uspješnih odbrana.

Za razliku od jesenjeg dijela sezone, kada su osvojili 17 bodova i zauzimali sedmu poziciju, proljeće su rukometaši Iskre odigrali kao preporođeni, te bez izgubljene utakmice, na kraju prvenstvo okončali na drugoj poziciji sa ukupno 46 bodova.

Odmah po okončanju prvenstva u Prvoj federalnoj ligi Jug za narednu sezonu iz MRK Iskre najavili su juriš na Premijer rukometnu ligu BiH.